आर ड्रम केमन्स क्लस्टरिंग हीटमैप

Question

मैं केमैन के साथ एक मैट्रिक्स क्लस्टर करना चाहता हूं, और इसे हीटमैप के रूप में प्लॉट करने में सक्षम हूं। यह काफी तुच्छ लगता है, और मैंने इस तरह के कई भूखंडों को देखा है। मैंने चारों ओर Google पर कोशिश करने की कोशिश की है, लेकिन इसके चारों ओर एक रास्ता नहीं मिल रहा है।

मैं इस आकृति पर पैनल ए या बी जैसे कुछ प्लॉट करने में सक्षम होना चाहता हूं। मान लें कि मेरे पास 250 पंक्तियों और 5 कॉलम के साथ एक मैट्रिक्स है। मैं सिर्फ पंक्तियों को कॉलम नहीं करना चाहता हूं।

m = matrix(rnorm(25), 250, 5) 

km = kmeans(m, 10) 

फिर मैं उन 10 क्लस्टर को हीटमैप के रूप में कैसे प्लॉट करूं? आप टिप्पणी करते हैं और मदद से अधिक मदद करता है।

धन्यवाद।

Answer 1

कुछ निम्नलिखित की तरह काम करना चाहिए:

set.seed(100) 
m = matrix(rnorm(10), 100, 5) 
km = kmeans(m, 10) 
m2 <- cbind(m,km$cluster) 
o <- order(m2[, 6]) 
m2 <- m2[o, ] 
library(pheatmap) # I like esoteric packages! 
library(RColorBrewer) 
pheatmap(m2[,1:5], cluster_rows=F,cluster_cols=F, col=brewer.pal(10,"Set3"),border_color=NA) 

Answer 2

मुझे लगता है कि दोनों दो आंकड़े संयुक्त दो आंकड़े से आना चाहिए। बायां वाला हीटमैप है और क्लस्टर परिणामों के आधार पर दायां रंग सही है। बेशक, क्लस्टर के परिणाम से डेटा को फिर से व्यवस्थित किया जाना चाहिए। बीटीडब्ल्यू, सवाल प्रश्न के नीचे टिप्पणी के रूप में दो प्रश्नों के समान नहीं है।