पायथन: PyTables में एक numpy multidimensional सरणी कैसे स्टोर करें?

Question

मैं PyTables का उपयोग कर एक HDF5 फ़ाइल में एक numpy multidimensional सरणी कैसे डाल सकता हूं?

जो मैं कह सकता हूं उससे मैं एक पाइटेबल्स तालिका में एक सरणी फ़ील्ड नहीं डाल सकता।

मुझे इस सरणी के बारे में कुछ जानकारी स्टोर करने की आवश्यकता है और उस पर गणितीय गणना करने में सक्षम होना चाहिए।

कोई सुझाव?

Answer 1

वहाँ एक आसान तरीका हो सकता है, लेकिन यह आप इसे कैसे करने के बारे में जाना चाहते हैं, जहाँ तक मैं जानता हूँ कि यह है:

import numpy as np 
import tables 

# Generate some data 
x = np.random.random((100,100,100)) 

# Store "x" in a chunked array... 
f = tables.openFile('test.hdf', 'w') 
atom = tables.Atom.from_dtype(x.dtype) 
ds = f.createCArray(f.root, 'somename', atom, x.shape) 
ds[:] = x 
f.close() 

आप संपीड़न का उपयोग करने के लिए निर्दिष्ट करने के लिए चाहते हैं, पर एक नजर है tables.Filters। जैसे

import numpy as np 
import tables 

# Generate some data 
x = np.random.random((100,100,100)) 

# Store "x" in a chunked array with level 5 BLOSC compression... 
f = tables.openFile('test.hdf', 'w') 
atom = tables.Atom.from_dtype(x.dtype) 
filters = tables.Filters(complib='blosc', complevel=5) 
ds = f.createCArray(f.root, 'somename', atom, x.shape, filters=filters) 
ds[:] = x 
f.close() 

वहाँ शायद इस का एक बहुत का बेहद सरल तरीका है ... मैं एक लंबे समय में तालिका जैसी डेटा के अलावा और कुछ के लिए pytables उपयोग नहीं किया है।

नोट: pytables 3.0 के साथ, f.createCArrayf.create_carray को दिया गया था। यह भी ईमानदारी से सीधे सरणी स्वीकार कर सकते हैं, atom निर्दिष्ट किए बिना,

f.create_carray('/', 'somename', obj=x, filters=filters)